ภาวะแทรกซ้อนของลำไส้ใหญ่อักเสบเป็นแผล ลำไส้ใหญ่อักเสบ ได้แก่ความเสี่ยงที่เพิ่มขึ้นของการเป็นมะเร็งลำไส้การเจริญเติบโตและพัฒนาการที่ไม่ดีในเด็กและเยาวชนนอกจากนี้ ยาสเตียรอยด์ที่ใช้ในการรักษาอาการลำไส้ใหญ่บวมเป็นแผลอาจทำให้กระดูกอ่อนแอลง (โรคกระดูกพรุน) ซึ่งเป็นผลข้างเคียง